Юити Катагири происходит из малообеспеченной семьи. Мать внушала ему, что дружба важнее материальных ценностей. Юити устроился на работу, чтобы накопить деньги на совместное путешествие с четырьмя друзьями. После того как все ученики сдали средства, сумма была похищена. Подозрение пало на двух друзей Юити - Сихо и Махото, которые отвечали за сбор денег. Между школьниками начались конфликты и поиски вора. Вскоре все пятеро пропадают. Придя в себя, они обнаруживают себя в незнакомом помещении.

Мальчик по имени Шириши Кун обладает способностью оставаться незамеченным для окружающих. Он ежедневно посещает школу, но одноклассники и учителя редко замечают его присутствие в классе. Шириши Кун ведет себя тихо, не привлекает к себе внимания и предпочитает наблюдать за происходящим со стороны. За одной партой с главным героем сидит девочка по имени Кубо Сан. Она является единственной, кто замечает Шириши Куна и его необычную особенность быть невидимым для других. Кубо Сан проявляет интерес к

Действие разворачивается в мире, где существуют два враждующих клана ниндзя — Инга и Кога. Конфликт между ними длится настолько долго, что его первоначальная причина уже утрачена. Противостояние включает не только традиционные боевые искусства, но и использование технических изобретений. В конечном итоге, утомлённые многолетними потерями, кланы заключают мирный договор. Спустя несколько лет наследники кланов, Кога Гэнносукэ и Ига Оборо, влюбляются друг в друга и планируют союз, чтобы закрепить