Пять сантиметров в секунду

Рюка Макой в детстве стала свидетельницей убийства своего отца. Она не запомнила лиц нападавших, но голос одного из них сохранился в её памяти. Спустя годы Рюка выросла и отправилась в путешествие по Японии с целью найти убийц. Её путь привёл в академию Ханнодзи — учебное заведение, где обучают боевым искусствам. Академией управляет Сацуки Кирюин, чей голос кажется Рюке знакомым. Девушка намерена добиться встречи с Кирюин, чтобы узнать подробности смерти отца.

Семья Кирюин владеет технологией создания «боевых волокон». Эти нити при вплетении в школьную форму наделяют владельца особыми способностями. В академии существует иерархия: однозвёздочные ученики, двухзвёздочные лидеры спортивных команд и трёхзвёздочная четвёрка, в которую входят члены студенческого совета. Сацуки Кирюин отказывается разговаривать с новыми учениками, поэтому Рюке необходимо доказать своё мастерство в бою.

После очередного проигранного боя Рюка случайно попадает в старый подвал академии. Там она находит форму, которую сшил её отец специально для дочери. В этой форме Рюка становится быстрее и сильнее. Теперь у неё появляется возможность на равных сражаться с опытными бойцами академии и добиться встречи с Сацуки Кирюин.